Описание
The dataset represents the historical part of the Herbarium of V. N. Karazin Kharkiv National University (CWU). Specimens in these collections were collected by well-known botanists and naturalists of the 19th century.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 669 записей.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Bondarenko H, Siranskyi V, Gamulya Y (2023). Historical collections in the Herbarium of V. N. Karazin Kharkiv National University (CWU). Version 1.1. V. N. Karazin Kharkiv National University. Occurrence dataset. https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=hystorcollectionsherbariumcwu&v=1.1
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является V. N. Karazin Kharkiv National University. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 0cb31d3e-b730-4d8f-8397-cb41b5215cd2. V. N. Karazin Kharkiv National University отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.
Ключевые слова
CWU; Rabenhorst; Gottsche; Livermoss; Algae; Cyanobacteria; Cyanoprokaryota; Exsiccata; Occurrence
Контакты
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact ●
- Principal Investigator
https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0001-9936-3482
- Metadata Provider ●
- Originator
- Curator ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Point Of Contact
Географический охват
The geography of the specimens covers mainly Europe but some occurrences were made in Northern Africa, and Central and Southern Asia.
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [15,284, -22,5], Север Восток [69,163, 95,625] |
|---|
Таксономический охват
N/A
| Kingdom | Plantae |
|---|---|
| Phylum | Marchantiophyta |
| Class | Jungermanniopsida, Marchantiopsida |
| Order | Spaerocarpales, Fossombroniales, Ptilidiales, Blasiales, Sphaerocarpales, Metzgeriales, Marchantiales, Pelliales, Jungermanniales, Porellales |
| Family | Targioniaceae, Scapaniaceae, Lepidoziaceae, Aytoniaceae, Blepharostomataceae, Plagiochilaceae, Conocephalaceae, Fossombroniaceae, Gymnomitriaceae, Cephaloziaceae, Ricciaceae, Metzgeriaceae, Sphaerocarpaceae, Riellaceae, Ptilidiaceae, Blasiaceae, Lophoziaceae, Myliaceae, Trichocoleaceae, Marchantiaceae, Anastrophyllaceae, Radulaceae, Herbertaceae, Lophocoleaceae, Pelliaceae |
Временной охват
| Период формирования | 1800s' |
|---|
Данные проекта
The main purpose is to make data from the Herbarium of V. N. Karazin Kharkiv National University (CWU) available to others. Within this project, we digitalized the historically valuable collections that are deposed in the Herbarium CWU (Exsiccata).
| Название | V. N. Karazin Kharkiv National University Herbarium (CWU) Digitalization |
|---|---|
| Идентификатор | Cepa-LT-2017/10049 |
| Финансирование | Financial support for the project was provided by BioDATA partners, NLBIF, GBIF Norway, and the UiO Natural History Museum (Norway). UiO-NHM's project budget for BioDATA (project number Biodata Cepa-LT-2017/10049, UiO project number 101063). |
Исполнители проекта:
Методы сбора
We extracted the information from herbarium labels. Most records have modified names of taxa in case they have corresponding names in the GBIF Backbone Taxonomy or other nomenclature checklists available in the GBIF (e.g. Lejeunia spp. that is mentioned in the labels we fixed into Lejeunea spp.). Nevertheless, some nomenclature names were given according to the original names given on labels. The dataset contains the original descriptions (in German, Latin, French etc.) of the locality and the modified descriptions in English. We determined the geographical coordinates of each record based on the locality description. We used open sources (Google Maps, Google Earth, OpenStreet Map, the images of old maps etc.) to find the approximate locality where the specimens were collected. However, some labels have no enough information to find even an approximate locality so these records contain information about the country of the gatherings only.
| Охват исследования | The dataset contains the records of the specimens collected from Europe in the Middle of the 19th century. Most specimens were gathered from the territory of modern Germany, Austria, Italy, Denmark, Sweden, and so on. |
|---|---|
| Контроль качества | Data quality control was provided using some tools that fix different types of mistakes. We fix the mechanical mistakes in OpenRefine and taxonomical mistakes in integrated to the GBIF Species matching tool. |
Описание этапа методики:
- 1. Creating the spreadsheet in GoogleSheets. It is a useful method to make the row database in different places, on different devices, at any time. 2. To determine what kind of fields and how to give names to them correctly, we used information from the GBIF's webpage 'Data quality requirements: Occurrence datasets' (https://www.gbif.org/uk/data-quality-requirements-occurrences) and Darwin Core Quick Reference Guide (https://dwc.tdwg.org/terms/#resourcerelationship). 3. Based on information from herbarium labels, we filled the fields for each herbarium specimen. 4. Each specimen was scanned and images were downloaded to cloud storage. 5. The links to images must be added to the field with a corresponding record. 6. Download the spreadsheet with the database in .csv format. 7. Upload the spreadsheet (.csv file) to OpenRefine for data cleaning. 8. Data cleaning includes some steps. E.g. delete excessive whitespaces at the beginning and the end of a word and between words. Conjunctive similar words into one correct value. Faceting the dates and coordinates. 9. Checking the correspondence of the nomenclature names with the GBIF Backbone Taxonomy (https://www.gbif.org/tools/species-lookup) and fixing the mistakes in the taxonomy.
Данные коллекции
| Название коллекции | Гербарій Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна (CWU) |
|---|
| Методы сохранения образцов | Dried and pressed |
|---|
Дополнительные метаданные
| Альтернативные идентификаторы | 0cb31d3e-b730-4d8f-8397-cb41b5215cd2 |
|---|---|
| https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=hystorcollectionsherbariumcwu |