Algae of the soils of Ukraine

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 11,596 records.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versions

The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.

How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Kostikov I, Romanenko P, Demchenko E, Dariienko T, Mykhailiuk T, Rybchynskyi O, Solonenko A, Bezsmertna O (2024). Algae of the soils of Ukraine. Version 1.1. Ukrainian Nature Conservation Group (NGO). Occurrence dataset. https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=algaekostikovdatabase&v=1.1

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Ukrainian Nature Conservation Group (NGO). This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 698acdc4-d9fb-42dd-a2a2-71042f4fa624.  Ukrainian Nature Conservation Group (NGO) publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Participant Node Managers Committee.

Keywords

Occurrence; soils; algae; microorganisms; biodiversity; Ukraine; plants; bacteria; protozoa; Observation

Contacts

I. Kostikov

• Originator

UA

P. Romanenko

• Originator

UA

E. Demchenko

• Originator

UA

T. Dariienko

• Originator

UA

T. Mykhailiuk

• Originator

UA

O. Rybchynskyi

• Originator

UA

A. Solonenko

• Originator

UA

Olesya Bezsmertna

• Metadata Provider ●
• Originator ●
• Point Of Contact

M.G. Kholodny Institute of Botany of the National Academy of Sciences of Ukraine

Kyiv

UA

Oleksii Marushchak

• Custodian Steward

junior researcher

I. I. Schmalhausen Institute of Zoology NAS of Ukraine

Vul. B. Khmelnytskogo, 15

01030 Kyiv

UA

ecopelobates@gmail.com

+380964882670

https://orcid.org/0000-0001-9380-5593

Geographic Coverage

The dataset covers entire territory of Ukraine.

Taxonomic Coverage

The dataset consists of records of algae and other microorganisms extracted from the soild of Ukraine.

Temporal Coverage

Sampling Methods

Algofloristic studies, the results of which formed the basis of this dataset, were conducted according to a single strictly unified methodology and covered all systematic groups of algae, all physiographic zones and mountain regions of Ukraine, all types of zonal soils and vegetation. According to the commonly used method, the soil is collected in paper envelopes that were previously sterilized in an autoclave at a pressure of 0.5-1.5 atm for 30 minutes and more, or roasted in an oven at 130-150o for 1 hour. Soil sampling is carried out with a knife, digger or sampler that is sterilized directly in the field: the tool is wiped with alcohol and then repeatedly inserted into the soil under investigation. The selected samples are processed either in a fresh state within 1-2 days from the moment of selection, or dried in a dark place to an air-dry state and stored for further processing for several months (usually up to six). The main differences in collection methods that affect the quality of subsequent floristic or phytocenological processing are the type of sample taken (individual or combined) and, partially, the amount of soil sampled (in the case of an individual sample). An individual sample is taken, as a rule, if there are local macroscopic growths of algae on the soil (skin, crusts, "blooming") in order to establish or investigate the species forming these growths. An individual sample covers a small depth (mostly only 1-2 mm), has a small area (up to 10 cm2) or is generally a separate algal thallus The combined soil sample is taken, as a rule, during floristic and coenological studies. Sampling is carried out within one phytocenosis from a trial plot, the size of which varies from 5-30 m2 in grassy phytocenoses to 100-2500 m2 in forest phytocenoses. The combined sample consists of 5-50 individual samples, the area of ​​each of which is from 1 to 25 cm2; at the same time, the total area of ​​all individual samples that made up the combined sample in the works of different authors ranges from 10 to 400 cm2. According to our data, the number of species in the combined sample detected by the same type of processing methods increases rapidly with an increase in the total area of ​​the combined sample in the range of 10-25 cm2, and, starting with an area of ​​30-40 cm2, more or less stabilizes . Therefore, combined samples, consisting of at least 5 individual samples and having a total area of ​​more than 30-40 cm2, are suitable for trial comparisons, if the sampling points of individual samples were chosen randomly. When selecting combined samples, which was carried out by the authors of this work, the following requirements were met: the combined sample consisted of 10 individual samples with an area of ​​3x3 cm or 20 individual samples with an area of ​​2x2 cm, or 5 individual samples with an area of ​​4x4 cm, stochastically selected to a depth of up to 2 cm of the A1 soil horizon from a test plot within one phytocenosis. When studying phytocenoses of one type, a six-fold minimum repetition of combined samples was adopted. The completeness and quality of species identification depends to an extraordinary degree on the method of sample processing. According to M.M.Hollerbach and E.A. Shtyna (Hollerbach, Shtyna, 1969), the methods used in the determination of soil algae can be divided into two groups: direct microscopy of freshly selected samples and cultural processing methods. Direct microscopy Direct microscopy is extremely useful in studying algal macroscopic growths and in determining algal abundance and biomass. In some cases, the authors of this work used direct microscopy to identify even systematically difficult species during quantitative surveys of algae (for example, on steep slopes of ravines and bare sands). Cultural methods Cultural methods used in soil-algological practice for the determination of algae are divided into four groups: the method of soil cultures, the method of accumulative cultures on liquid nutrient media, the method of accumulative cultures on agarized nutrient media, and the method of pure cultures. All these methods were used during the research of phytoedaphon of Ukraine. The method of accumulating cultures on an agar medium A small amount of soil from a freshly selected sample or soil culture is sown on 1.5-2% agarized nutrient medium. After some time (usually two to four weeks), colonies of various algae develop on the agar. Algae that have formed colonies are identified, and individual species (of course, taxonomically difficult) are isolated for further processing into pure cultures. Cultivation conditions under which algae are grown on a 1.5-2% agar medium at a temperature of 20±3oC, periodic illumination with an intensity of 1800-3000 lux and a 12/12-hour or 16/8-hour alternation of light and dark phases are called in soil algology standard or usual (Bold, 1970; Deason, 1976). Pure cultures In many cases, only the use of pure cultures makes it possible to accurately determine the species of specific soil algae. Algologically pure cultures are usually sufficient to determine systematically critical species, but if physiological tests or biochemical analyzes (primarily pigment composition) are required for determination, bacterially pure cultures are required.

Method step description:

1. Organizing of samples' collecting following the commonly used methodology.
2. Growing of the cultures of some organisms from the samples.
3. Species identification using microscopes nad other modern tools.
4. Georeferencing.
5. Publishing of the results in a form of a monograph.
6. Extracting of the information from the monograph with subsequent creation of the dataset according to Darwin Core standards.

Bibliographic Citations

1. І. Ю. Костіков, П. О. Романенко, Е. М. Демченко, Т. М. Дарієнко, Т. І. Михайлюк, О. В. Рибчинський, А. М. Солоненко Водорості грунтів України (історія та методи дослідження, система, конспект флори)/ - Київ, 2001. - 284 с.
2. Андреева В.М., Чаплыгина О.Я., Стрелкова Л.А. Почвенные хлорококковые и хлоросарциновые водоросли Украинского Полесья // Новости систематики низших растений. – 1985. - 22. – С. 3-20.
3. Байрак О.М., Гапон С.В., Леванець А.А. Безсудинні рослини Лівобережного Лісостепу України (грунтові водорості, лишайники, мохоподібні). – Полтава: Верстка, 1998. – 160 с.
4. Гаврилов К.А. Влияние состава лесонасаждений на микрофлору и фауну лесных почв // Почвоведение. – 1950. - №3. – С. 129-141.
5. Альбицкая М. А., Гаухман З.С., Долгова Л.Г., Дубина А.А., Травлеев Л.П. Материалы к микроструктуре ольшанника (Присамарье) // Вопросы степного лесоведения и охраны природы: Тр. комплекс. экспед. ДГУ. - 1975. - Вып.5. – С. 86-99.
6. Горовиц-Власова Л.М. К вопросу о санитарном изучении городских почв (исследование почвы г. Днепропетровска) // Гигиена и эпидемиология. – 1927. - №8. – С. 11-21.
7. Гаухман З.С. Некоторые данные о почвенных водорослях Кочережского лесничества // Вопросы степного лесоведения и охраны природы: Тр. комплекс. экспед. ДДУ. – 1968. - Вып.1. – С. 70-76.
8. Виноградова О.М. Синьозеленi водоростi грунтiв Карадазького державного заповiдника // Укр. ботан. журн. – 1989. - 46, №1. – С. 40-45.
9. Кислова О.А., Кондратьева Н.В. О жизнеспособности Nostoc commune Vauch. sensu Elenk. (Cyanophyta) после многолетнего хранения в воздушно-сухом состоянии // Альгология. – 1995. - 5, №2. – С. 130-133.
10. Зауер Л.М. О водорослях некоторых почв степного Крыма в связи с вопросом о роли водорослей в жизни почв // Очерки по растительному покрову СССР: Ученые записки ЛГУ. Серия геогр. наук. – Сб. 2, №213. – Ленинград, 1956. – С. 279 – 294.
11. Кабиров Р.Р., Степанов А.Н., Черненькова Т.В. Устойчивость популяций почвенных водорослей к радиоактивному загрязнению // Альгология. – 1991. - 1, №4. – С. 51-58.
12. Кондрат’єва Н.В. Матерiали до вивчення синьозелених водоростей м. Києва та його околиць // Ботан. журн. АН УРСР. – 1951. - 8, №1. – С. 71-87.
13. Кондратьєва Н.В. Синьозелені водоростi деяких оброблюванних грутiв з околиць Києва // Укр. ботан. журн. – 1959 а. - 16, №1. – С. 74-86.
14. Кондратьєва Н.В. Синьозеленi водоростi деяких грунтiв степового Криму // Укр. ботан. журн.- 1959 б. - 16, №6. – С. 30-39.
15. Кондратьєва Н.В., Кислова О.А. Залежність розмірних ознак клітин Anabaena cylindrica Lemm. (Cyanophyta) від календарного віку зразка культури // Укр. ботан. журн.- 1990. - 47, №1. – С. 48-52.
16. Мальцева И.А. К формированию сообществ почвенных водорослей акациевого насаждения на рекультивированных землях Западного Донбасса // Экологические проблемы аграрного производства. Материали конф. – Днепропетровск: ДСГI, 1992 а. – С.144.
17. Мальцева И.А. Почвенные водоросли лесных насаждений на рекультивированных шахтных отвалах Западного Донбасса // Екологія та ноосферологія. – 1996. - 2, №3-4. – С. 129-133.
18. Костиков И.Ю., Леванец А.А. Новый вид рода Gloeobotrys Pasch. (Xanthophyta, Gloeobotrydaceae) из почв заповедника "Каменные Могилы" (Украина) // Альгология. – 1996. - 6, №1. – С. 76-81.
19. Мартынова Е.А. Водорастворимые соли как фактор формирования альгосинузий отвалов вскрышных пород доломитовых разработок // Изучение, охрана и рациональное использование природных ресурсов. Тез. научн. конф. – Уфа, 1989 а. – С.16.
20. Масюк Н.П., Ліліцька Г.Г. Цікаві та рідкісні види роду Chlamydomonas Ehr. (Chlorophyta) з Українських Карпат // Укр. ботан. журн.- 1997.- 54, №1. – С. 31-42.
21. Мартынова Е.А. Мезорельеф отвалов доломитовых разработок Донбасса в связи с особенностями формирования почвенных альгогруппировок // Природно-ресурсный потенциал Донбасса. – Донецк: ДГУ, 1992 а. – С. 77-84. (Деп. Укр. ИНТЭИ 25.06.92, № 931. – Укр92).
22. Матвиенко А.М. К изучению почвенных водорослей Крыма и Северного Кавказа // Ботан. журн.- 1956.- 41, №9. – С. 1360-1363.
23. Матвиенко А.М. Почвенные водоросли окрестностей Харькова // Ботан. журн.- 1958. - 43, №8. – С. 1108-1120.
24. Масюк Н.П., Лилицкая Г.Г. Новые для флоры Карпатского биосферного заповедника (Украина) виды Chlorophyta и Xanthophyta) // Альгология. - 1996, 6, №4. – С. 447-455.
25. Приходькова Л.П. Синезеленые водоросли почв степной зоны Украины. – К.: Наукова думка, 1992. – 218 с.
26. Приходькова Л.П., Виноградова О.М. Синьозеленi водоростi грунтiв Чорноморського державного бiосферного заповiдника АН УРСР // Укр. ботан. журн.- 1988.- 45, №5. – С. 41-45.
27. Хижняк Н.А., Дацун Э.И. Водоросли – индикаторы загрязнения окружающей среды // Тез. докл. VII съезда УБО. – К.: Наук. думка, 1982. – С.325.
28. Москвич Н.П. Опыт альгологической характеристики санитарного состояния почв населенных мест: Автореф. дис.... канд. биол. наук. – Ворошиловоград., 1972 б. – 24с.
29. Москвич Н.П. Опыт использования водорослей при изучении санитарного состояния почв. - Ботан. журн., 1973, 58, №3. – С. 412-416.
30. Черевко С.П. К состоянию альгофлоры почв как компонента лесного биогеоценоза Присамарья // Кадастровые исследования степных биогеоценозов Присамарья Днепровского, их антропогенная динамика и охрана. Межвуз. сборн. научн. тр. – ДГУ, 1991. – С. 207-213.
31. Черевко С.П. Альгофлора почв как элемент лесного биогеоценоза в степи // Промышленная ботаника: состояние и перспективы развития. Тез. докл. междунар. научн. конф. (май 1993г., Кривой Рог). – Донецк, 1993 а. – С. 197-198.
32. Черевко С.П. Почвенные водоросли в подстилке основных лесных биогеоценозов Присамарья // Биомониторинг лесных экосистем степной зоны. Межвуз. сборн. научн. тр. – Днепропетровск: Изд-во ДГУ, 1992. – С. 142-146.
33. Черевко С.П., Мальцева І.А. Грунтові водорості рекультивованих земель Присамар’я Дніпровського (Україна) // Укр. ботан. журн.- 1994 а.- 51, №2-3. – С. 144-148.
34. Черевко С.П., Мальцева И.А. Водоросли почв лесных биогеоценозов Присамарья Днепровского и древесных насаждений Западного Донбасса. // Мониторинговые исследования биогеоценотических катен степной зоны. Межвузовский сборник научных трудов. – Днепропетровск, 1995. – С.67-64.
35. Штина Э.А. Почвенные водоросли Карпатского заповедника и их диагностическое значение // Тез. докл. VI Делегатского съезда ВБО (12-17 сентября 1994 г., Кишинев). – Л.: Наука, 1978. – С.338.

Additional Metadata