Barcoded Reticulariaceae of the World

Записи данных

Данные этого находка ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 476 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Leontyev D, Yatsiuk I (2023). Barcoded Reticulariaceae of the World. Version 1.10. V. N. Karazin Kharkiv National University. Occurrence dataset. https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=reticulariaceae&v=1.10

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является V. N. Karazin Kharkiv National University. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 2b767e54-7921-4908-af93-84a9c35264c1.  V. N. Karazin Kharkiv National University отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen taxonomicAuthority

Контакты

Географический охват

Europe, Asia, Northern America, Southern America, Australia

Таксономический охват

Family Reticulariaceae and allies, Class Myxomycetes

Методы сбора

The data for this dataset were collected and processed during the previous taxonomic studies. Nearly all of the research material, with the exception of several old collections, underwent molecular barcoding, primarily involving the 18S rDNA gene, but also the elongation factor 1a gene (EF1a) and mitochondrial cytochrome oxidase subunit I gene (COI). For those sequences that are stored in the NCBI GenBank, accession numbers are provided in the dataset. It should be noted that identical sequences obtained from different accessions were not published in GenBank as separate records in the 2014–2019 publications. Therefore, for most of the Alwisia, Siphoptychium and Tubifera accessions included in the dataset, the numbers with which they share an identical barcode are given, rather than their own GenBank numbers. In such cases, the table contains the indicator "ident." (the barcode is identical to the following accession number).

Описание этапа методики:

1. Method steps 1. Specimens acquisition. Specimens were either collected in the field by authors of publications referenced herein or loaned from herbaria collections. 2. Morphological examination and DNA barcoding. For these data refer to the publications cited herein. 3. Taxonomic assessment. The data presented here served as a basis for original taxonomic studies including the description of new taxa. 4. Digitization of herbaria labels. 5. Georeferencing of occurrences. 6. Preparation of the dataset in DwC terms. 7. Data cleaning using OpenRefine (2022) and QGIS (QGIS Development Team, 2020)

Библиографические ссылки

1. Leontyev D.V., Buttgereit M., Kochergina A., Shchepin O., Schnittler M. 2023a. Two independent genetic markers support separation of the myxomycete Lycogala epidendrum into numerous biological species. Mycologia. 114 (6). P.1–12. https://doi.org/10.1080/00275514.2022.2133526
2. Leontyev D.V., Ishchenko Y., Schnittler M. 2023b. Fifteen new species from the genus Lycogala (Myxomycetes). Mycologia. 115 (4): 524–560. https://doi.org/10.1080/00275514.2023.2199109
3. Leontyev D., Schnittler M., Moreno Horcajada G., Stephenson S., Mitchell D.W., Rojas C. 2014a. The genus Alwisia (Myxomycetes) revalidated, with two species new to science. Mycologia 106(5): 936–948. https://doi.org/10.3852/13-314
4. Leontyev D., Schnittler M., Stephenson S. 2015. A critical revision of the Tubifera ferruginosa complex. Mycologia 107 (5): 959–985. https://doi.org/10.3852/14-271
5. Leontyev D.V., Schnittler M. 2023. What are Lycogala confusum and L. exiguum? Revising authentic collections of myxomycetes in the light of a molecular-aided species concept. Nova Hedwigia 116 (3−4): 403–416 https://doi.org/10.1127/nova_hedwigia/2023/0820
6. Leontyev D.V., Schnittler M., Stephenson S.L. 2014b. A new species of Alwisia (Myxomycetes) from new South Wales and Tasmania. Mycologia 106(6): 1212–1219. https://doi.org/10.3852/14-075
7. Leontyev D.V., Schnittler M., Stephenson S.L., Novozhilov Y.K. Systematic revision of the Tubifera casparyi T. dictyoderma complex: Resurrection of the genus Siphoptychium and introduction of the new genus Thecotubifera. Mycologia. 2019. 111(6). P. 981–997. https://doi.org/10.1080/00275514.2019.1660842
8. Lloyd S.J., Leontyev D.V., Dagamac N.H. Three new species of Tubifera from Tasmania and New South Wales. Phytotaxa. 2019. N 414 (5). P. 240–252. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.414.5.2
9. OpenRefine (2022) OpenRefine: A free, open source, powerful tool for working with messy data. 3.5.2. Release date: 2022-1-26.URL: https://openrefine.org/
10. QGIS Development Team, 2020. QGIS Geographic Information System. Open Source Geospatial Foundation Project. http://qgis.osgeo.org.

Дополнительные метаданные