Description
The dataset contains detailed sampling data on the mole rats (genus Spalax and Nannospalax) used for phylogenetic analyses.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 64 enregistrements.
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Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Rusin M (2024). Blind mole rat (Spalacidae) sampling, used for phylogenetic analyses. Version 1.2. Ukrainian Nature Conservation Group (NGO). Occurrence dataset. https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=spalaxoccurrenceeateu1&v=1.2
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Ukrainian Nature Conservation Group (NGO). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 368d59c2-8b6e-45a5-9209-ead5a8461614. Ukrainian Nature Conservation Group (NGO) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Participant Node Managers Committee.
Mots-clé
Occurrence; Spalax; mole rat; rodents; biodiversity; Eastern Europe; Nannospalax; mammals; Observation
Contacts
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
https://orcid.org/0000-0003-4349-4795
- Curateur Des Données
Couverture géographique
The dataset consists of records from Romania, Ukraine and Russia.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [43,24, 23,72], Nord Est [48,657, 47,49] |
|---|
Couverture taxonomique
The dataset consists of rodents from genera Spalax and Nannospalax.
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Class | Mammalia |
| Order | Rodentia |
| Family | Spalacidae |
| Genus | Spalax, Nannospalax |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2009-05-15 / 2019-04-09 |
|---|
Méthodes d'échantillonnage
41 new original samples of seven Spalacidae were collected in Ukraine, Romania and Russia during 2016-2019 years. Additional samples denote material accessible via GenBank (19 samples). Mole rats were collected in the field using hoe technic, gophinator traps or hand-picked (live captured during dispersal above ground or road mortality). Tissue samples were collected in 96% ethanol. DNA isolation and amplification has been performed in the Zonguldak Bülent Ecevit University (Türkiye) and sequencing outsourced in Macrogen (the Netherlands). One mitochondrial gene (full cytochrome b) and one nuclear gene (first exon of IRBP) were obtained for most of the samples. All original nucleotide data uploaded to NCBI GenBank.
| Etendue de l'étude | The dataset consists of records of small rodents from Spalacidae family made on the territory of Romania, Ukraine and Russia in the period from 2009 to 2019 by author with the help of additional resources. |
|---|---|
| Contrôle qualité | All species identified in the field, and with genetic markers. |
Description des étapes de la méthode:
- Surveys for mole rats: detailed results of surveys available at https://www.gbif.org/dataset/5c216d11-fe9a-4953-b9e4-1feb0b8bf788; https://www.gbif.org/dataset/3cc90eba-6de4-4d39-8f9a-8e1770120f10; https://www.gbif.org/dataset/599f4843-f07a-4369-8c53-ae4fb561f5e1.
- Animal trapping.
- Sample storage in ethanol.
- DNA isolation.
- DNA amplification.
- DNA sequencing.
- Uploading original nucleotide sequences to NCBI GenBank.
- Preparing a dataset of samples according to Darwin Core standards.
Citations bibliographiques
- Rusin, M., Çetintaş, O., Ghazali, M., Sándor, A. D., & Yanchukov, A. (2023). Underworld: Evolution of blind mole rats in Eastern Europe. Preprint.
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- Spradling TA, Hafner MS, Demastes JW (2001) Differences in Rate of Cytochrome-b Evolution Among Species of Rodents. J Mammal 82:65–80. https://doi.org/10.1644/1545-1542(2001)082<0065:DIROCB>2.0.CO;2
Métadonnées additionnelles
| Identifiants alternatifs | 368d59c2-8b6e-45a5-9209-ead5a8461614 |
|---|---|
| https://ukraine.ipt.gbif.no/resource?r=spalaxoccurrenceeateu1 |